Химиотерапия является распространённым методом лечения рака, однако эффективность химиотерапевтических препаратов часто значительно ограничена возникновением лекарственной устойчивости. Опухоли пищеварительного тракта являются одной из распространённых злокачественных опухолей во всем мире, и преодоление лекарственной устойчивости является ключом к улучшению прогноза лечения. Аутофагия — это катаболический механизм поддержания гомеостаза клеток, который играет двоякую роль в лекарственной устойчивости опухолей пищеварительного тракта: с одной стороны, защитная аутофагия участвует в формировании лекарственной устойчивости опухолей; с другой стороны, чрезмерная или продолжительная аутофагия может вызывать аутофагическую смерть опухолевых клеток, что приводит к обратному развитию устойчивости. Таким образом, целенаправленное регулирование аутофагии стало важной стратегией преодоления лекарственной устойчивости опухолей. В настоящей статье систематически излагается классификация и базовые процессы аутофагии, описывается двунаправленная регуляция аутофагии при лекарственной устойчивости опухолей пищеварительного тракта, а также подводятся итоги исследований по комбинированному применению ингибиторов или активаторов аутофагии для преодоления лекарственной устойчивости, с целью предоставления новых идей и оснований для противораковой терапии опухолей пищеварительного тракта.