2011年から2024年までの南陽市におけるマイコプラズマ肺炎菌流行予測モデルの構築及び分子疫学的特徴の解析

Wang Hai-Xia ,  

Wu Yue ,  

Zhao Ying-Ying ,  

Feng Yang-Fan ,  

Du Wei-Peng ,  

Zhang Shu-Lin ,  

Zhou Hong-Bing ,  

Gong Hao ,  

Chai Sen ,  

摘要

本研究の目的は、南陽市におけるマイコプラズマ肺炎菌(Mycoplasma pneumoniae, MP)感染の流行動向、病原学的特徴、およびMP遺伝子変異と進化の状況を解析し、臨床検査室におけるMP検出能力評価と感染症対策の根拠を提供することである。方法として、2011年1月から2024年3月までの南陽市中心病院の発熱患者117,382例のMP検査データを遡及的に収集し、MP感染の流行特徴、耐薬性変化、検査方法学の差異を分析した。R言語による時系列解析に基づき、ARIMAモデルを用いて実験室検査のMP-IgM陽性率をモデル化し、適合度統計量BICに基づき最適なMP感染予測モデルを選定した。米国GenBankデータベースからMP配列を取得し、MP原型株を参照に各分離株の接着蛋白(P1)領域を抽出して系統樹を作成し、遺伝的変異を解析した。結果として、2011年から2024年にかけて南陽市におけるMP感染流行は継続して存在し、2011年から2019年はMPと他の呼吸器多病原体が交替または重複して流行し、2020年から2022年はMP単独流行が上昇傾向にあり、2023年から2024年はMPとA型インフルエンザウイルス(IAV)の混合流行であった。MP感染患者は学齢前児童が主体であった。MPのマクロライド系抗生物質への耐薬性は波状の流行傾向に一致し、平均耐薬率は80%以上で、2024年に最も高く、耐薬性変異はすべてA2063G位置に由来した。蛍光定量PCR法及び1世代シーケンス法は肺胞洗浄液中のMP-DNA検出に顕著な優位性を有した。混合感染タイプは主にMP-IAVであり、14歳未満の患者ではMP-インフルエンザB型ウイルス、MP-ライノウイルス、MP-パラインフルエンザウイルス、MP-呼吸器合胞体ウイルス、MP-アデノウイルスの混合感染も認められた。最適なMP感染予測モデルはARIMA(2,1,3)(0,1,1)12で、予測精度が高かった。MP原型株と比較して、MP P1は異なる程度の進化を遂げており、南陽市で現在流行している遺伝子型はMP P1-II型である。結論として、南陽市におけるMP感染は継続的に流行しており、臨床検査において核酸検査とIgM検査の併用が合理的である。高い耐薬性率と混合感染はワクチンの普及と抗生物質の適切な使用が必要である。

关键词

マイコプラズマ肺炎菌;流行変遷;検査法

阅读全文