L'objectif est de sélectionner les gènes pivot liés à l'autophagie dans les lésions d'ischémie-réperfusion rénale et d'analyser leurs fonctions biologiques pour élucider les mécanismes de la maladie. Douze souris ont été randomisées en groupe témoin et groupe ischémie-réperfusion (n=6). Les tissus rénaux de chaque souris de chaque groupe ont été prélevés pour le séquençage du transcriptome, les données de séquençage ont été soumises à un contrôle de qualité, les résultats filtrés ont été utilisés pour sélectionner les différences dans l'expression des gènes entre les deux groupes (DEGs). Ces gènes ont ensuite été croisés avec les gènes liés à l'autophagie (ATG) pour obtenir les ATG-DEGs, puis les meilleurs ATG-DEGs ont été sélectionnés en tant que gènes pivot à l'aide de 4 algorithmes dans Cytohubba, et une analyse d'enrichissement mono-génique (GSEA) a été réalisée. Les données d'expression de gènes de deux souris liées à la lésion au niveau de la réplication et de la réabsorption ont été téléchargées de la base de données GEO des États-Unis, et une analyse RNA-Seq a été effectuée au niveau unicellulaire, ainsi qu'une analyse de l'infiltrat immunitaire. La technique qRT-PCR a été utilisée pour mesurer le niveau d'expression des gènes pivot chez les souris. Les résultats ont montré qu'il y avait 672 DEGs dans chaque groupe de souris ; une analyse de l'ontologie génique (GO) et une analyse d'enrichissement génétique de Kyoto et des génomes (KEGG) ont montré que les DEGs pourraient être liés à l'autophagie ; 6 gènes pivot ont été obtenus : la glycoprotéine-1 des cellules phagocytaires (Cd44), l'alpha-M-globuline de liaison (Itgam), l'alpha-X-globuline de liaison (Itgax), le récepteur kinase de domaine d'insertion (Kdr), la phosphoprotéine sécrétée (Spp1), la glycérinaldéhyde-3-phosphate déshydrogénase (GAPDH), tous étant liés au stress oxydatif, à la réponse inflammatoire, aux voies de l'apoptose, à la réponse immunitaire et à d'autres voies de signalisation. Sur la base des données GEO liées à RIRI, 2 gènes pivot (Cd44, Itgam) dans le groupe de lésion rénale ischémique ont été soumis à une analyse transcriptionnelle, et ont montré une forte expression dans les cellules neutrophiles, les macrophages et les fibroblastes par rapport au groupe témoin (P<0,05) ; l'infiltrat immunitaire cellulaire a montré que Cd44 et Itgam dans le groupe de lésion rénale ischémique ont une liaison plus forte avec les neutrophiles et les macrophages que dans le groupe témoin. Les résultats de la qRT-PCR ont montré que le niveau d'expression des gènes chez les souris du groupe de lésion rénale ischémique était nettement plus élevé que dans le groupe témoin (P<0,05).

Lésion ischémie-réperfusion rénale ; bioinformatique ; gènes pivot ; glycoprotéine-1 des cellules phagocytaires ; alpha-M-globuline