Établissement d’un modèle prédictif de l’épidémie de Mycoplasma pneumoniae à Nanyang (2011-2024) et analyse des caractéristiques moléculaire et épidémiologique

Wang Hai-Xia ,  

Wu Yue ,  

Zhao Ying-Ying ,  

Feng Yang-Fan ,  

Du Wei-Peng ,  

Zhang Shu-Lin ,  

Zhou Hong-Bing ,  

Gong Hao ,  

Chai Sen ,  

摘要

L’objectif est d’analyser les tendances épidémiologiques de l’infection à Mycoplasma pneumoniae (Mycoplasma pneumoniae, MP) à Nanyang, les caractéristiques pathogéniques, la variation des gènes MP et leur évolution, afin de fournir une base pour l’évaluation des capacités de détection de MP en laboratoire clinique et la prévention des épidémies. Une collecte rétrospective des données de détection MP a été réalisée sur 117 382 patients fébriles à l’hôpital central de Nanyang de janvier 2011 à mars 2024. Les caractéristiques épidémiologiques, les changements de résistance et les différences méthodologiques des tests en laboratoire ont été analysés. Une analyse en séries temporelles basée sur R a permis de modéliser le taux de positivité MP-IgM à l’aide du modèle ARIMA, le meilleur modèle a été sélectionné selon le critère BIC. Les séquences MP ont été obtenues de la base de données GenBank américaine, un arbre phylogénétique a été construit à partir de la région de la protéine d’adhérence (P1) des isolats, et une analyse des variations génétiques a été réalisée par rapport au prototype MP. Les résultats montrent une présence continue de MP à Nanyang entre 2011 et 2024 ; de 2011 à 2019, MP a circulé en alternance ou en co-infection avec d’autres agents pathogènes respiratoires, de 2020 à 2022, une circulation monophasique ascendante de MP a été observée, tandis que de 2023 à 2024, une co-circulation de MP et du virus influenza de type A (IAV) a été identifiée. Les patients infectés sont principalement des enfants d’âge préscolaire. La résistance de MP aux macrolides suit une tendance « ondulatoire » avec une résistance moyenne > 80 %, la résistance la plus élevée étant en 2024, les mutations résistantes proviennent toutes du locus A2063G. La PCR quantitative en fluorescence et le séquençage de première génération ont montré des avantages significatifs pour détecter l’ADN MP dans le liquide de lavage alvéolaire. Les infections mixtes les plus fréquentes sont MP-IAV ; chez les patients de moins de 14 ans, les co-infections concernent aussi MP avec virus influenza B, rhinovirus, virus parainfluenza, virus respiratory syncytial et adénovirus. Le meilleur modèle prédictif MP sélectionné est ARIMA(2,1,3)(0,1,1)12 avec une précision élevée. La protéine P1 de MP a évolué à des degrés divers par rapport au prototype, le génotype en circulation actuelle à Nanyang est MP P1-II. En conclusion, l’infection MP reste endémique à Nanyang ; la détection combinée de l’acide nucléique et de IgM est raisonnable ; la forte résistance aux antibiotiques et les infections mixtes nécessitent une vaccination généralisée et une utilisation rationnelle des antibiotiques.

关键词

Mycoplasma pneumoniae; évolution épidémique; diagnostic en laboratoire

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